Ce toponyme a été adopté dans le cadre de l'harmonisation des noms de rues, rendue nécessaire par le regroupement municipal du 1er janvier 2002. Conseiller municipal de Cap-Rouge en 1878, James Bowen est élu maire en janvier 1884. Il meurt en fonction quelque cinq mois plus tard. Lors de la session du 2 juin, les conseillers municipaux expriment leur regret à la suite du décès « d'un citoyen aussi entreprenant, d'un bienfaiteur si zélé, d'un père toujours prêt à promouvoir le bien-être du Cap-Rouge ».

Ancien toponyme
La rue James-Bowen portait auparavant le nom de rue De Callières, adopté vers 1978, en l'honneur de Louis-Hector de Callières (1648-1703), gouverneur de la Nouvelle-France de 1698 à 1703.