Ce toponyme a été adopté dans le cadre de l'harmonisation des noms de rues, rendue nécessaire par le regroupement municipal du 1er janvier 2002.

L'avenue du Bourg-la-Reine tire son nom d'un bourg dont l'intendant Jean Talon (1626-1694) avait fait le projet en 1666; elle passe sur le territoire que ce village aurait occupé. Arrivé en Nouvelle-France en 1665, Talon entend fonder trois bourgs : Bourg-Royal, Bourg-la-Reine et Bourg-Talon, conçus selon un plan radial, sur le modèle du Trait-Carré développé par les Jésuites. Pour ce faire, il exproprie une partie de la seigneurie de Notre-Dame-des-Anges, malgré l'opposition des Jésuites qui en sont propriétaires depuis 1626. Des trois villages projetés, seul Bourg-Royal verra le jour. Bourg-Talon ne sera jamais réalisé et Bourg-la-Reine, au nord de Bourg-Royal, prendra la forme d'un rang.

Anciens toponymes
L'avenue du Bourg-la-Reine portait à l'origine le nom d'avenue Grand-Pré, attribué vers 1953 et probablement inspiré par le nom de l'arrière-fief du Grandpré-de-la-Redoute. Cet arrière-fief, qui dépend de la seigneurie de Notre-Dame-des-Anges, propriété des Jésuites, est concédé à Jean Madry en 1659. La veuve de Madry, Françoise Duquet, le vend en 1718 à Michel Bégon (1667-1747), intendant de la Nouvelle-France. La propriété sera aussi connue sous les noms de Bégon, la Mistanguienne (1753) et Montplaisir (1758).

L'avenue Grand-Pré a reçu ensuite le nom d'avenue du Grand-Pré, adopté le 21 avril 1997. Il faisait allusion aux vastes champs qui s'étendaient dans ce secteur.